영녕전(永寧殿)은 ‘세실’과 ‘조천’의 예에 따라 정전에서 ‘조천(신주를 옮김)’된 왕과 왕비, 황제와 황후의 신주를 모시기 위해 1421년(세종 3)에 새로 지은 별묘(別廟)이다. 그 이름은 ‘왕실의 조상과 자손이 함께 길이 평안하다’라는 뜻을 담고 있다. 영녕전은 신주를 정전에서 옮겨 왔다는 뜻에서 조묘(祧廟)라고도 한다. 전체적으로 시설과 공간 형식은 정전과 유사하지만, 정전보다 규모가 작다.
영녕전의 구조는 가운데 4칸이 태조의 4대 조상인 추존 목조, 익조, 도조, 환조와 그 왕비를 모신 곳으로 좌우 협실보다 지붕이 높다. 좌우의 협실 각 6칸에는 정전에서 옮겨온 왕과 왕비 및 추존된 왕과 왕비, 황제와 황후의 신주를 모셨다. 영녕전은 1985년 보물로 지정되었다.
영녕전 신주 봉안도

| 신실 | 신주 | 신실 | 신주 |
|---|---|---|---|
| 1실 | 목조대왕 효공왕후 | 9실 | 예종대왕 장순왕후 안순왕후 |
| 2실 | 익조대왕 정숙왕후 | 10실 | 인종대왕 인성왕후 |
| 3실 | 도조대왕 경순왕후 | 11실 | 명종대왕 인순왕후 |
| 4실 | 환조대왕 의혜왕후 | 12실 | 원종대왕 인헌왕후 |
| 5실 | 정종대왕 정안왕후 | 13실 | 경종대왕 단의왕후 선의왕후 |
| 6실 | 문종대왕 현덕왕후 | 14실 | 진종소황제 효순소황후 |
| 7실 | 단종대왕 정순왕후 | 15실 | 장조의황제 헌경의황후 |
| 8실 | 덕종대왕 소혜왕후 | 16실 | 의민황태자 의민황태자비 |